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纪委（监察专员办公室）纪检监察室
党委组织部（党校办公室）
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党委安全稳定工作部（保卫处）
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教务处（教学评估与质量控制中心、教师教学发展中心、艺术教育中心、创新创业学院）
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学科建设与研究生工作处（学位委员会办公室）
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农业科技产业园管理中心
附属单位
附属张掖人民医院
第二附属医院（校医院）
甘肃河西学院资产经营管理有限责任公司
汽车驾驶员培训中心
科研平台
科研平台依据学校科研平台建设和管理有关办法设立，挂靠相应二级学院运行，由科研处管理。
基层党组织
马克思主义学院党委
经济管理学院党委
法学院党委
教师教育学院党委
文学院党委
外国语学院党委
历史文化与旅游学院党委
数学学院党委
物理与机电工程学院党委
化学化工学院党委
生命科学与工程学院党委
信息技术与传媒学院党委
土木工程学院党委
农业与生态工程学院党委
医学院党委（含第二附属医院）
护理学院党委
音乐学院党委
体育学院党委
美术学院党委
机关党委
附属张掖人民医院（临床医学院）党委
离退休教职工党委
图书馆党总支
甘肃河西学院资产经营管理有限责任公司党总支
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